Termékek

Infravörös spektroszkópiát alkalmaztak a szubsztrát-fehérje kölcsönhatások feltérképezésére: a szarkoplazmatikus retikulum Ca(2+)-ATPáz konformációs változásait a nukleotid kötődés és az ATPáz foszforiláció hatására a szubsztrát ATP és ATP analógjai (2'-deoxi-ATP, 3) segítségével követték nyomon. '-dezoxi-ATP és inozin-5'-trifoszfát), amelyek a szubsztrát specifikus funkciós csoportjain módosultak.Az adenin 2'-OH-jának, 3'-OH-jának és aminocsoportjának módosításai csökkentik az ATP-áz kötődés által kiváltott konformációs változásának mértékét, különösen erős hatást az utóbbi kettő esetében figyeltek meg.Ez mutatja a nukleotid-ATPáz komplex szerkezeti érzékenységét a nukleotid és az ATPáz közötti egyéni kölcsönhatásokra.Minden vizsgált csoport fontos a kötődés szempontjából, és egy adott ligandcsoport kölcsönhatása az ATPázzal más ligandumcsoportok kölcsönhatásaitól függ.Az ATPáz foszforilációját az ITP és a 2'-dezoxi-ATP esetében figyelték meg, a 3'-dezoxi-ATP esetében azonban nem.Nincs közvetlen kapcsolat a nukleotidkötés során bekövetkező konformációs változás mértéke és a foszforiláció sebessége között, ami azt mutatja, hogy az ATP-indukált konformációs változás teljes mértéke nem kötelező a foszforilációhoz.Amint azt a nukleotid-ATPáz komplexnél megfigyeltük, az első foszforilált ATPáz intermedier E1PCa(2) konformációja a nukleotidtól is függ, ami azt jelzi, hogy az ATPáz állapotok kevésbé egyenletes konformációval rendelkeznek, mint azt korábban vártuk.