Termékek

A kábítószer okozta májkárosodás a kábítószer-kopás egyik fő oka.A gyógyszerjelöltek májra gyakorolt ​​hatásainak kémiai szerkezetük alapján történő előrejelzésének képessége kritikus fontosságú ahhoz, hogy a kísérleti gyógyszerkutatási projekteket biztonságosabb gyógyszerek felé tereljék.Ebben a tanulmányban 951 olyan vegyületből álló adatsort állítottunk össze, amelyekről számoltak be, hogy számos hatást váltanak ki a májban különböző fajok esetében, beleértve az embereket, a rágcsálókat és a nem rágcsálókat is.Az ehhez az adathalmazhoz tartozó májhatásokat állítási metaadatokként kaptuk, amelyeket a MEDLINE absztraktokból generáltak a lexikális és nyelvi módszerek, valamint ontológiai szabályok egyedülálló kombinációjával.Ezt az adathalmazt hagyományos cheminformatikai megközelítésekkel elemeztük, és számos olyan kérdéssel foglalkoztunk, amelyek a májra gyakorolt ​​hatások fajok közötti egyezőségére, a májra gyakorolt ​​​​hatások kémiai meghatározóira vonatkoznak, valamint annak előrejelzésére, hogy egy adott vegyület valószínűsíthető-e májhatást okozni emberben.Megállapítottuk, hogy a májra gyakorolt ​​hatások összhangja viszonylag alacsony (kb. 39-44%) a különböző fajok között, ami felveti annak lehetőségét, hogy a fajspecifitás a kémiai szerkezet sajátos jellemzőitől függ.A vegyületeket kémiai hasonlóságuk alapján csoportosítottuk, és a hasonló vegyületeket megvizsgáltuk fajfüggő májhatásprofiljaik várható hasonlósága szempontjából.A legtöbb esetben hasonló profilokat figyeltek meg ugyanazon klaszter tagjainál, de néhány vegyület kiugró értékként jelent meg.A kiugró értékek a MEDLINE-ből, valamint más adatforrásokból származó fókuszált állítás-regenerálás tárgyát képezték.Egyes esetekben további biológiai állításokat azonosítottak, amelyek megfeleltek a vegyületek kémiai hasonlóságaira alapozott várakozásoknak.Az állításokat tovább alakították a mögöttes vegyi anyagok bináris annotációivá (azaz a májra gyakorolt ​​hatás a májra gyakorolt ​​hatás nélkül), és bináris kvantitatív szerkezet-aktivitás kapcsolat (QSAR) modelleket állítottak elő annak előrejelzésére, hogy egy vegyület várhatóan kiváltsa-e a májra gyakorolt ​​​​hatásokat emberben.Az adatok látszólagos heterogenitása ellenére a modellek jó prediktív képességet mutattak külső ötszörös kereszt-validációs eljárásokkal értékelve.A bináris QSAR-modellek külső prediktív erejét tovább erősítette azok alkalmazása olyan vegyületekre, amelyeket a modell kidolgozása után kerestek vagy tanulmányoztak.Legjobb tudomásunk szerint ez az első olyan kémiai toxicitás-előrejelzési vizsgálat, amely QSAR-modellezést és más cheminformatikai technikákat alkalmaz az automatizált szövegbányászat által generált megfigyelési adatokra, korlátozott kézi felügyelettel, új lehetőségeket nyitva meg a kémiai toxikológia generálására és modellezésére. adat.